Windows下连接远程Linux桌面

2018-01-25

一般我们是通过命令行界面来使用Linux服务器，但有时也需要用Linux图形界面的软件，如IGV。当需要显示的基因组信息比较大，如测序reads的基因组比对情况，会占用大量内存，在服务器上运行会比较流畅。下面是本地windows电脑显示远程Linux服务器桌面的方法。

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编程语言之C语言

2018-01-05

C语言是一门通用的计算机编程语言，广泛应用于系统与应用软件的开发。它是由Dennis Ritchie与Ken Thompson于1969年至1973年间，为了移植与开发UNIX操作系统，在贝尔实验室设计与开发。C语言具有高效、灵活、功能丰富、表达力强和可移植性好等特点。C语言的设计影响了众多后来的编程语言，例如C++、Objective-C、Java、C#等。

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Hello World

2018-01-01

Welcome to Hexo! This is your very first post. Check documentation for more info. If you get any problems when using Hexo, you can find the answer in troubleshooting or you can ask me on GitHub.

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文献检索

2017-10-13

科研似乎是比较高大上的词，但英文“research”更能表达它的意思，就是反复(re)搜索(search)文献。大牛牛顿都说他的成功是站在巨人的肩膀上(Stand on the shoulders of giants)。从事科研都要先查文献，看看别人做了什么或先学习怎么做，运气好的，如获诺奖的菁蒿素就是屠youyou从我国传统医学文化宝库的古籍堆里找到的秘方，才被提取用于疟疾的治疗。

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Ubuntu 16.04LTS安装QIIME

2017-09-03

Ubuntu 16.04LTS安装QIIME

构建Ubuntu环境
Linux已内置python且version>2.7，需安装其余必备软件包，版本验证 python –version。
$sudo apt-get install build-essential python-dev python-pip

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数据分析的多重检验问题(multiple testing)

2017-08-26

数据分析中常碰见多重检验(multiple testing)问题，如利用基因芯片数据比较分析两个样品间是否有差异表达基因，或利用质谱定量数据鉴定某一个蛋白在两个样品中是否存在差异表达等。
一般选取差异表达基因有两标准：
(1) Fold Change，即两个样品中同一个基因的表达水平变化倍数;
(2) p-value，即通过T检验等统计学方法计算每个基因的P值。

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Javascript-based bioinformatics

2017-08-26

A guru of biostar.org predict the future of bioinformatics will need Javascript programming.

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Microbiome visualization

2017-07-20

前段时间让朋友帮我做了一个微生物组小项目的网页(Saliva microbiome visualization)，像是一个入口，通往生物科技的远方。特纪念一下。我07年在芝加哥大学学习的时候，开始做酵母基因组的研究。这10年时间,几乎靠一人之力做黄酒酵母基因组，还好得到了两个国家基金的资助，勉强算做成(完)了:(‘。从17年开始，我打算做微生物与健康相关...

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